MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanobacterium sp. SWAN-1 chromosome

Total Repeats: 40714

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015574	GAT	2	6	64638	64643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986295
1002	NC_015574	TAA	2	6	64664	64669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986295
1003	NC_015574	GAT	2	6	64680	64685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986295
1004	NC_015574	TGAA	2	8	64786	64793	50 %	25 %	25 %	0 %	333986295
1005	NC_015574	ATGA	2	8	64884	64891	50 %	25 %	25 %	0 %	333986295
1006	NC_015574	GCT	2	6	65034	65039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986295
1007	NC_015574	CAGGGA	2	12	65073	65084	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	333986295
1008	NC_015574	AC	3	6	65303	65308	50 %	0 %	0 %	50 %	333986295
1009	NC_015574	ACA	2	6	65311	65316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986295
1010	NC_015574	TGA	2	6	65366	65371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986295
1011	NC_015574	A	6	6	65371	65376	100 %	0 %	0 %	0 %	333986295
1012	NC_015574	AAT	2	6	65384	65389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986295
1013	NC_015574	GT	3	6	65395	65400	0 %	50 %	50 %	0 %	333986295
1014	NC_015574	ACA	2	6	65434	65439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986295
1015	NC_015574	AGG	2	6	65473	65478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333986295
1016	NC_015574	TAT	2	6	65496	65501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986295
1017	NC_015574	ACA	2	6	65523	65528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986295
1018	NC_015574	TGT	2	6	65624	65629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986295
1019	NC_015574	CAC	2	6	65699	65704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333986295
1020	NC_015574	AGC	2	6	65736	65741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986295
1021	NC_015574	ACA	3	9	65742	65750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986295
1022	NC_015574	ATA	2	6	65764	65769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986295
1023	NC_015574	GCT	2	6	65847	65852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986295
1024	NC_015574	TGC	2	6	65858	65863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986295
1025	NC_015574	ATG	2	6	65901	65906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986295
1026	NC_015574	CCT	2	6	65916	65921	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333986295
1027	NC_015574	TTA	2	6	66014	66019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986295
1028	NC_015574	AAC	2	6	66092	66097	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986295
1029	NC_015574	TGC	2	6	66122	66127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986295
1030	NC_015574	ATA	2	6	66204	66209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986295
1031	NC_015574	CAATT	2	10	66227	66236	40 %	40 %	0 %	20 %	333986295
1032	NC_015574	GCA	2	6	66246	66251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986295
1033	NC_015574	CA	3	6	66259	66264	50 %	0 %	0 %	50 %	333986295
1034	NC_015574	TTA	2	6	66269	66274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986295
1035	NC_015574	CCT	2	6	66366	66371	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333986295
1036	NC_015574	ACA	2	6	66434	66439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986295
1037	NC_015574	TGA	2	6	66542	66547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986295
1038	NC_015574	AT	3	6	66552	66557	50 %	50 %	0 %	0 %	333986295
1039	NC_015574	AACC	2	8	66579	66586	50 %	0 %	0 %	50 %	333986295
1040	NC_015574	GGA	2	6	66612	66617	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333986295
1041	NC_015574	ATG	2	6	66637	66642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986295
1042	NC_015574	TA	4	8	66891	66898	50 %	50 %	0 %	0 %	333986295
1043	NC_015574	ATG	2	6	66901	66906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986295
1044	NC_015574	TAA	2	6	67015	67020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986295
1045	NC_015574	CAA	2	6	67033	67038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986295
1046	NC_015574	AAG	2	6	67063	67068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986295
1047	NC_015574	ATA	2	6	67087	67092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986295
1048	NC_015574	CCTTG	2	10	67127	67136	0 %	40 %	20 %	40 %	333986295
1049	NC_015574	TAA	2	6	67244	67249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986295
1050	NC_015574	TA	3	6	67289	67294	50 %	50 %	0 %	0 %	333986295
1051	NC_015574	AGC	2	6	67326	67331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986295
1052	NC_015574	CAT	2	6	67439	67444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986295
1053	NC_015574	TAA	2	6	67499	67504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986295
1054	NC_015574	A	6	6	67536	67541	100 %	0 %	0 %	0 %	333986295
1055	NC_015574	GT	3	6	67612	67617	0 %	50 %	50 %	0 %	333986295
1056	NC_015574	AAT	2	6	67785	67790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986295
1057	NC_015574	TGC	2	6	67802	67807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986295
1058	NC_015574	TAC	2	6	67871	67876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986295
1059	NC_015574	CAG	2	6	67943	67948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986295
1060	NC_015574	CA	3	6	67983	67988	50 %	0 %	0 %	50 %	333986295
1061	NC_015574	TGT	2	6	68054	68059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986295
1062	NC_015574	AAT	2	6	68088	68093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986295
1063	NC_015574	GCT	2	6	68106	68111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986295
1064	NC_015574	CAG	2	6	68246	68251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986295
1065	NC_015574	CA	3	6	68286	68291	50 %	0 %	0 %	50 %	333986295
1066	NC_015574	TGT	2	6	68357	68362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333986295
1067	NC_015574	AAT	2	6	68391	68396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986295
1068	NC_015574	CATC	2	8	68512	68519	25 %	25 %	0 %	50 %	333986295
1069	NC_015574	CA	3	6	68589	68594	50 %	0 %	0 %	50 %	333986295
1070	NC_015574	AAT	2	6	69004	69009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986296
1071	NC_015574	TAA	2	6	69082	69087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986296
1072	NC_015574	TAA	2	6	69206	69211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986296
1073	NC_015574	T	6	6	69222	69227	0 %	100 %	0 %	0 %	333986296
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1077	NC_015574	TCA	2	6	69461	69466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986296
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1080	NC_015574	ATGG	2	8	69598	69605	25 %	25 %	50 %	0 %	333986296
1081	NC_015574	CCA	2	6	69609	69614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333986296
1082	NC_015574	TTC	2	6	69637	69642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986296
1083	NC_015574	ACA	2	6	69760	69765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986296
1084	NC_015574	GGA	2	6	69801	69806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333986296
1085	NC_015574	TGGAAA	2	12	69815	69826	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	333986296
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1087	NC_015574	AGGA	2	8	69936	69943	50 %	0 %	50 %	0 %	333986296
1088	NC_015574	AAGAT	2	10	69944	69953	60 %	20 %	20 %	0 %	333986296
1089	NC_015574	CAG	2	6	70134	70139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986297
1090	NC_015574	GCAT	2	8	70142	70149	25 %	25 %	25 %	25 %	333986297
1091	NC_015574	TAC	2	6	70243	70248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986297
1092	NC_015574	GAA	2	6	70253	70258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986297
1093	NC_015574	AAG	2	6	70373	70378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986297
1094	NC_015574	TGA	2	6	70413	70418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333986297
1095	NC_015574	A	6	6	70474	70479	100 %	0 %	0 %	0 %	333986297
1096	NC_015574	A	6	6	70484	70489	100 %	0 %	0 %	0 %	333986297
1097	NC_015574	GCA	4	12	70639	70650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333986297
1098	NC_015574	T	6	6	70656	70661	0 %	100 %	0 %	0 %	333986297
1099	NC_015574	TAAGA	2	10	70668	70677	60 %	20 %	20 %	0 %	333986297
1100	NC_015574	GGT	2	6	70682	70687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333986297
1101	NC_015574	GAG	2	6	70690	70695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333986297
1102	NC_015574	AGA	2	6	70758	70763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986298
1103	NC_015574	AAT	2	6	70877	70882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986298
1104	NC_015574	CA	3	6	70893	70898	50 %	0 %	0 %	50 %	333986298
1105	NC_015574	ACA	2	6	70921	70926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986298
1106	NC_015574	AAT	2	6	70928	70933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333986298
1107	NC_015574	AAG	2	6	70936	70941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986298
1108	NC_015574	CAA	2	6	70999	71004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333986298
1109	NC_015574	TA	3	6	71471	71476	50 %	50 %	0 %	0 %	333986299
1110	NC_015574	CAT	2	6	71488	71493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986299
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1113	NC_015574	TGC	2	6	71588	71593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333986299
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1117	NC_015574	CT	3	6	72027	72032	0 %	50 %	0 %	50 %	333986299
1118	NC_015574	CCAC	2	8	72118	72125	25 %	0 %	0 %	75 %	333986299
1119	NC_015574	TCT	2	6	72190	72195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986299
1120	NC_015574	AGA	2	6	72237	72242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333986299
1121	NC_015574	TCA	2	6	72279	72284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986299
1122	NC_015574	CT	4	8	72335	72342	0 %	50 %	0 %	50 %	333986299
1123	NC_015574	TCT	2	6	72347	72352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333986299
1124	NC_015574	TTA	2	6	72396	72401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333986299
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1126	NC_015574	ATTCCA	2	12	72678	72689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333986299
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